《魔法使的注意事项》描绘了一个人人都有机会成为魔法使的世界。只要完成相关手续，任何人都能合法施展魔法，让日常生活变得更加便利。不过，魔法使分为见习与正式两种，见习魔法使必须遵守魔法守则，认真修炼，并积极运用魔法帮助他人，才有机会获得正式资格。
天真可爱的少女菊池梦（宫崎葵配音）正是一名善良的见习魔法使。为了接受进一步训练，她离开家乡前往东京。面对繁华陌生的大都市，初来乍到的梦一度不知所措，好在得到路人的帮助，终于找到了自己的导师小山田雅美（诹访部顺一配音）。
魔法究竟为何存在？它带来的到底是幸福，还是灾难？怀抱着这些疑问，梦开始了在东京的修行。随着一次次经历人生中的悲欢离合，她也逐渐理解了魔法真正存在的意义。
