无敌王的故事始于遥远的过去。某颗星球上，名为泽诺·帕拉斯的文明高度发展，却也因此毁灭了自己的母星。为了延续族群，他们将遗传信息封存在移民战舰中，由少数被选中的成员负责操纵飞船，其余人则将希望寄托在他们身上，陷入漫长沉睡。
移民船员肩负着唯一的使命：寻找宇宙中据说愿意接纳他们的约定之星泰拉，并完成族群迁徙。经过漫长航行，他们终于找到了泰拉。然而，这颗星球上已经存在着自行发展出独特文明的初期人类。面对这一事实，泽诺·帕拉斯分裂成两派：强硬派主张消灭或统治当地人，迅速完成移民；温和派则希望通过漫长的沟通，与当地文明达成共存的解决方案。
双方的矛盾最终演变成战争。并不擅长战斗的温和派逐渐被强硬派压制，在走向灭亡之际，他们决定采取最后的手段：将三台名为泽农斯守护者的机器人连同搭载它们的战舰送往泰拉，交给当地居民，让他们代替温和派对抗强硬派。
化作流星坠落泰拉的泽农斯守护者，分别降临在这颗被称为地球的星球上、日本的蝦夷地、江户和萨摩。随后，机器人与战舰被生活在当地的原住民深埋地下封存，这一切发生在江户时代。
时光流转至现代，已经做好准备的泽诺·帕拉斯终于向地球发起侵略。当名为泰拉的地球陷入危机之际，来自北海道、东京和鹿儿岛的三道希望之光即将升空，肩负起拯救星球命运的使命。
