在妖怪与人类共同生活的世界里，妖怪被分为激进派与保守派。激进派屡屡制造危及人类安全的事件，于是人类成立了专门处理此类案件的机构“妖人省”。这里聚集着拥有一半妖怪血统的人类，他们与普通人类组成搭档，共同调查各种由妖怪引发的不可思议事件。
西王石榴（中原麻衣 配音）便是妖人省的一员。她的搭档总角景（樱井孝宏 配音）是一名外表英俊、内心却极度惧怕妖怪的军官，石榴也常拿他的胆小取笑。与此同时，性格内向的薄萤（花泽香菜 配音）与芳野葛利剑（日野聪 配音）搭档行动；古灵精怪的双胞胎姐妹鬼灯（堀江由衣 配音）和雪洞（丰崎爱生 配音）则与她们的准夫君花桐丸龙（尾裕贵 配音）一同登场。随着调查不断深入，石榴成为半妖的真正原因也逐渐浮出水面。
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