皇家国教骑士团讲述了发生在英国某座村庄的异变：吸血鬼与食尸鬼肆虐横行，给当地居民带来深重灾难。专门负责消灭反基督怪物的皇家国教骑士团Hellsing随即派出强大而可怖的吸血鬼杀手阿尔卡特。战斗中，阿尔卡特成功击溃邪物，却也令倒霉的女警察西洛斯·维多利亚变成吸血鬼，随后她加入了Hellsing。
不久之后，Hellsing总部遭到近乎毁灭性的袭击。随着一连串诡异事件接踵而至，一个名为千禧年的邪恶组织逐渐现身。这个组织由战败的纳粹军官组成，为洗刷二战失败的耻辱，他们不惜制造吸血鬼军团。多方势力由此卷入一场正邪交锋，激烈的大战也正式拉开帷幕。
本片改编自平野耕太创作的同名漫画，是该作品的TV动画版本，之后又被制作成OVA重新发行。
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