江户盗贼团五叶讲述了秋津政之助的故事。阿政性格胆怯又容易害羞，因而在生活中屡屡碰壁，甚至频繁丢掉工作。一次，他刚被解雇，便偶然遇见了神秘男子弥一。弥一自称想聘请阿政担任自己的贴身保镖，正无所事事的阿政很快答应了这份工作，却没想到因此被卷入一场绑架案件。原来，弥一正是声名显赫的犯罪团伙五叶的首领。
迫于生计，阿政最终成为五叶的一员。这个团伙中，有身份成谜的弥一、外表美丽妖艳的阿竹、嘴硬心软的梅造，以及沉默寡言的松吉。随着与他们逐渐相处，阿政开始看见这些身份扑朔迷离、行事亦正亦邪的浪人们不为人知的另一面，而他自己也由此踏上了一段意想不到的经历。
