鸨羽舞衣和弟弟巧海乘坐着摇晃的邮轮，准备前往名为“风华学园”的高等学校。父母双亡的舞衣意外获得了风华学院的奖学金，于是决定带着弟弟一起转入这所学校。航行途中，舞衣发现海面上漂浮着一名少女，便将她救上了船。少女名叫美袋命，怀中还抱着一把巨大的剑。不久之后，一名神秘的长发女子玖我夏树也出现在船上。她一见到命，便立刻对其发动攻击，并召唤出机械兽投入战斗。面对突如其来的激战，舞衣震惊不已，而她自身隐藏的超能力也在此刻觉醒。原来，舞衣同样拥有被称为“HiME力量”的特殊能力。战斗结束后，舞衣与巧海继续踏上前往风华学园的旅程，却不知道等待他们的，除了HiME力量背后的秘密，还有无法逃脱的宿命束缚。
