赌博默示录的故事始于一艘行驶在黑夜中的赌船。男主角伊藤开司终日浑浑噩噩，一事无成，却因替他人担保而背上数百万债务。为了偿还欠款，他在他人怂恿下登上名为希望之船的渡轮，参加一场神秘赌局。只要获胜，所有债务便可一笔勾销。
然而登船之后，开司才发现，其他参赛者大多也是和自己一样走投无路的失败青年。主办方随后公布了赌局规则：参赛者必须使用标有石头、剪刀、布的扑克牌，与对手进行较量并夺取对方身上的星星标志。赌局结束时，若手中的扑克牌尚未用完，或拥有的星星少于三颗，就会失去参赛资格。与此同时，参赛者入场时能够向主办方借取的巨额资金，也成为他们争取获利乃至逃出生天的关键。
