来自星星的你讲述了一段跨越四百年的奇幻爱情。17世纪初，一艘不明飞行物出现在朝鲜上空，来自外星的都敏俊由此与地球结下不解之缘。如今，他以大学教授的身份生活在韩国人群中，默默度过了在地球滞留的四百年。三个月后，一枚彗星将接近地球，届时他便有机会离开这里，返回自己的故乡。
然而，在离开之前，都敏俊始终无法忘记初到地球时遇见的少女徐宜花，也一直盼望着再次见到那个在12年前曾被自己救过的小女孩。此时，他与备受争议的国民偶像千颂伊成为邻居，而千颂伊恰好还是他任教大学的学生。两人的初次相处并不融洽，但随着接触增多，敏俊逐渐发现，眼前这个女孩竟与自己的过去有着深厚而神秘的联系。
跨越漫长岁月，他们之间的缘分始终没有断绝。历经几度轮回，命运再次让这对男女重逢。
