《亲亲海豚》讲述了宁波某小学五年级学生珍珍的成长故事。珍珍的母亲卓文娟是海洋世界董事长，父亲是一名企业家，优越的家庭条件让她从小便有些优越感。然而这个暑假，父亲出国，母亲忙于工作，还为她安排了许多家教和培训，既没人陪她玩，也无法带她去旅行。珍珍最大的愿望只是去看看大海，却始终未能如愿，因此逐渐产生了叛逆情绪，经常故意和母亲对着干。
为了提升海洋世界的知名度，卓文娟从大连水族馆购进了一头可爱的海豚波波，准备给观众带来惊喜。珍珍得知此事后却无动于衷。一次放假期间，她到好友莉莉家玩，认识了莉莉阿姨艾美丽患有自闭症的儿子小宁。莉莉告诉她，和海豚接触有助于自闭症孩子康复，希望珍珍帮忙让小宁到海洋世界和波波接触。珍珍抱着几分幸灾乐祸的心情答应下来，起初还遭到了驯养员阿海的反对，但她最终说服了阿海。小宁与波波接触后果然有了明显进步，可这件事很快被卓文娟发现，母女之间再次发生冲突。珍珍甚至以不回家相要挟，卓文娟只得暂时妥协。
为了减少家教和培训项目，珍珍在死党诸葛胖的建议下，假装自己患有“躁狂症”，想借此吓唬母亲。与此同时，她和莉莉也计划带小宁继续与波波接触。卓文娟担心女儿的身体和心理状况，最终同意了他们的请求。
后来，珍珍和父母到机场接父亲回国，一家人终于准备去看大海。就在这时，他们得知波波突然生病。原来，波波不知什么时候吞下了一只矿泉水瓶，身体十分难受。在小宁的提示和诸葛胖的主意下，珍珍找来手臂很长的父亲，将手伸进波波胃里取出了矿泉水瓶，波波也很快恢复了健康。
波波即将进行公开表演时，珍珍却迟迟没有出现，卓文娟十分焦急。原来，诸葛胖的父母早已离异，他的父亲本来就患有高血压，为了养活孩子长期拼命工作，最终中风瘫痪。诸葛胖最近一直在医院陪护父亲，如今奶奶准备把父亲带回老家，他也将随之转学。珍
