《乱世儿女》将故事置于三十年代的旧上海。各方势力盘根错节，局势动荡不安。乡下青年小虎（元彪 饰）来到上海，寻找在英租界担任上校军官的哥哥大虎（林子祥 饰）。没想到刚抵达当晚，他便卷入一场因争夺巨额海外捐款而爆发的枪战，现场死伤惨重。
在新结识的马戏团朋友帮助下，小虎终于找到了哥哥。大虎正直刚烈、嫉恶如仇，却因身处乱世而势单力薄。由于迟迟无法铲除租界内猖獗的毒品走私，上司派他负责保护金爷（洪金宝 饰）从海外归来的干女儿宋璧君（梅艳芳 饰）。宋璧君曾是大虎的恋人，如今为了追查失踪的捐款，再次秘密返回上海。随着两人重逢，爱情、友情、亲情与国家道义彼此交织，在风云诡谲的旧上海激烈碰撞。
