芳香之城传奇讲述了世外桃源芳香之城的公主苏凌芳（朱茵饰）。城堡即将毁灭时，堡主将她放入小船，任其顺流漂泊，后来被教堂神父救起并收养。苏凌芳天生失语，却拥有一副能仅凭一个“啊”字打动世人的天籁之音，身上还散发着奇异芳香。随着神父离世，她神秘的身世也被彻底掩埋，只能独自生活。
一次偶然的机会，苏凌芳救下了因父亲倒台、为躲避仇家追杀而逃亡的80后富少蒋少君（扎西顿珠饰）。身受重伤的蒋少君在养伤期间爱上了这个不谙世事的女孩，并许诺一生保护她。然而，长期与世隔绝的生活让他再次怀念起从前纸醉金迷的都市日子。一次与老欧（张达明饰）无意间通电话时，他的行踪因此暴露，随后被仇家抓走并囚禁。
为了寻找蒋少君，苏凌芳独自踏入从未接触过的现实世界。历经重重波折后，她终于与爱人重逢。起初，蒋少君打算利用苏凌芳的天籁之音重返娱乐圈，但在真爱的感召下，他最终获得了灵魂的救赎，并用自己的方式守护着心爱的女孩。
