《杀手阿一》的故事发生在新宿歌舞伎町一座被称为“流氓公寓”的民宿大厦，这里是山口组的据点。黑社会组织安生组的老大安生芳雄，带着情妇和一亿日圆现金突然失踪，此后，流氓公寓里几乎每天都有黑道人物惨遭杀害。人们纷纷猜测，幕后凶手正是传说中的杀手“Ichi”。
安生组的武斗派头目垣原（浅野忠信饰）随即展开疯狂追查。这个极度迷恋受虐的男人，将自己崇拜的老大视若神明。垣原轻信了退役江湖人物阿叔的话，绑架敌对帮派头目并施以酷刑逼供，结果掀起一场席卷黑道的风暴，也让安生组陷入进退两难的境地。安生芳雄的情妇Karen（孙佳君饰）与阿叔相识，为了讨好垣原，她决定冒险行动，并在阿叔的帮助下逐步接近神秘杀手阿一。《杀手阿一》是三池崇史的代表作之一，以极端血腥和暴力的视觉风格，将残酷美学推向极致。
