《怪奇物语第二季》与第一季紧密相连，故事时间大约相隔一年。第二季开篇设定在一年后的万圣节，地点依旧是印第安纳州的霍金斯小镇。几个孩子换上抓鬼敢死队的服装，其中最引人注目的仍然是威尔。第一季结尾，他咳嗽时吐出了一条虫子，这一细节也为后续剧情埋下伏笔。
制作人之一马特·杜菲表示，威尔似乎能够看见表里世界（the Upside Down）的景象，但这些画面究竟是真实存在，还是仅仅源于他的心理创伤，仍然难以确定。种种表现看起来像是他正在遭受创伤后应激障碍。
与此同时，过度担忧、甚至显得有些神经质的乔伊斯（薇诺娜·瑞德饰），正努力让两个儿子的生活重新回归稳定。她开始与高中时期的同学鲍勃（肖恩·奥斯汀饰）交往，试图为孩子们的成长生活带来一位可靠的父亲。
霍珀警长（大卫·哈伯饰）则面临一堆棘手的问题。新一季中，他需要设法平息事态，并保护乔伊斯和孩子们。
