《是，大臣第三季》讲述了在野党影子内阁成员Jim Hacker协助本党赢得大选后，获任行政事务部（DAA）部长的故事。上任之后，他开始面对以部秘书Sir Humphrey Appleby为首的公务员体系，而他的公派私人秘书、同为公务员的Bernard，则被夹在政客与官僚之间。
围绕施政问题，代表政客的Hacker与代表公务员的Appleby不断发生冲突，两人的关系也在相互掩饰和彼此揭短之间反复变化。与此同时，英国政治体制，包括政党制度与公务员体系中鲜为人知的弊端和内幕，也通过一连串充满讽刺意味的喜剧情节与机锋对白呈现在观众面前。
在本系列后半部分的《Yes Prime Minister》中，Hacker经过党内角力成为首相，而Appleby也早于他升任首相秘书。两人的故事由此转移到唐宁街10号，继续展开。
