《上海大风暴粤语》的故事发生在三十年代的上海。欧阳日本是一名私家侦探，父亲遭人暗杀后，他为查明真相并替父报仇展开调查，结果发现最大嫌疑人竟是自己的童年好友关志培。后来，在关志培的妹妹佩佩协助查证下，志培终于洗脱嫌疑。
原来，欧阳日的父亲是被刚将势力转移到上海的董家帮首领董一峰，以及他的得力助手马群所杀。马群实际上是日军安插的卧底，他借助董一峰的势力，挑起上海各帮会之间的仇杀。与此同时，欧阳日的爱侣于婷遭到马群绑架，马群还找来间谍横田秋子易容冒充于婷，利用于婷祖父经营的医院进行细菌实验，企图借此吞并中国。
欧阳日在层层追查的过程中，发现董一峰竟是自己的亲生兄弟，也察觉到于婷的行为异常。直到这时，他才意识到自己面对的并非普通案件，而是一场牵涉国际势力的巨大阴谋。随着真相逐步揭开，一场场斗智斗力的较量随之展开。
