夜樱家的大作战 第二季 Part 2中，太阳与夜樱家众人合力消灭了皮下真率领的犯罪组织蒲公英，夜樱前线行动圆满成功，太阳和六美也举行了婚宴，夜樱家终于迎来平静的日常。然而，一项新的任务却随之而来。
一天，太阳在梦中见到了夜樱家初代当家夜樱蕾。蕾告诉他，想要实现杀了我这个愿望，还缺少两个不可或缺的关键。为了遵循蕾的指引，并接触掌握其中秘密的皮下，太阳决定参加银级特务考试。可传闻称，今年不会有任何人通过考试，而等待他的，正是一群凶狠至极的考官。
与此同时，六美等人的父亲夜樱百露出了无畏的笑容，开始采取行动。这个始终被重重谜团笼罩的男人究竟有着怎样的目的？接连不断的事件降临夜樱家，家人之间的羁绊也将面临考验。电视动画夜樱家的大作战全新篇章，就此拉开序幕。
