《马尔科姆的一家第三季》延续了中产阶级家庭男孩马尔科姆的成长故事。马尔科姆原本只是个普通孩子，直到有人发现他的智商高达165，并把他转入克瑞博尼天才班。可在这个聚集了怪人和小丑的班级里，天才生活并不轻松：老师卡洛琳要求学生排成方队跳舞，结果招来其他孩子的嘲笑和投掷，令马尔科姆尴尬不已。成为天才后，他发现家人和周围人对自己的态度也发生了变化。
爸爸哈尔被认为是个永远长不大的孩子，制造的麻烦甚至比几个儿子还多；妈妈露易丝则是家中的女王，尤其擅长用一个眼神让孩子们乖乖交代自己做过的坏事。大哥弗朗西斯是马尔科姆崇拜的对象，曾让他替自己给女朋友送信，却因为父母无法接受他的叛逆和酷劲，被送进军事学校。二哥里斯性格粗暴，最喜欢拳击，得知马尔科姆是天才后，竟把弟弟当成了练习靶子。弟弟杜维则像一种尚未完成进化的奇怪生物，自称能和狗交流，嗅觉敏锐，真正令人头疼的却是他惊人的破坏力，凡是能够碰到的东西，不是被他吃掉，就是被砸得粉碎。
在新的班级里，马尔科姆认识了坐轮椅的斯蒂维。虽然斯蒂维有些古怪，但因为收藏了大量漫画书，两人渐渐成了朋友。随着年龄增长，女孩也成了马尔科姆面对的新难题，大哥弗朗西斯传授的办法始终派不上用场。与此同时，家里迎来了新成员，妈妈生下了小弟弟杰米，这让马尔科姆很高兴，因为家中终于多了一个新的替罪羊。里斯长得更高，拳头也更硬了，只是头脑依旧迟钝；弗朗西斯则从阿尔巴马搬到阿拉斯加，又打算前往新墨西哥，只要能不回家，他似乎连南极都愿意去。
马尔科
