《筋肉人THE LOST LEGEND》将故事设定在2019年11月。由园子温执导、改编自国民英雄漫画《筋肉人》的真人电影《MUSCLEMAN》正处于企划制作阶段，然而就在制作发表的前一天，剧组却突然遭遇了麻烦。
与此同时，真荣田乡敦正在健身房刻苦训练，接到了《MUSCLEMAN》制片人兼罗宾假面饰演者绫野刚的联系，对方邀请他出演战争人。乡敦对这次出演邀约感到欣喜，却不知道这部真人化作品背后隐藏着一段不为人知的过去。随后，他与饰演米特的玉城缇娜一同展开调查，试图揭开围绕《筋肉人》真人化而出现的种种不可思议现象。
