停止!! 云雀讲述了坂本耕作在母亲去世后失去依靠，只能遵照母亲遗言，前往投奔她生前的好友大空家。没想到，大空家的主人大空自豪，竟是关东无恶不作联盟关东大空组的组长。得知这一身份后，耕作担心自己的人身安全，正准备逃离时，一名美少女突然出现在他面前。对她一见钟情的耕作因此改变主意，决定继续住在大空家，却没料到真正的热闹才刚刚开始。
耕作后来才发现，自己初见的那位美少女其实是大空家的长子云雀，而燕子、闭与和麻雀三姊妹才是家中真正的美人。云雀在学校里女扮男装的秘密，家族成员早已知情。面对耕作，云雀不仅表现出明显的好感，还主动展开追求。随着两人之间不断掀起骚动，大空家的每一天都变得喧闹异常，几乎让人没有片刻喘息的机会。
