《圣斗士星矢：冥王哈迪斯十二宫篇》讲述了神话时代的一场生死之战。奥林匹克众神中，始终不乏企图征服天空、海洋与大地的野心家。遥远的过去，冥王哈迪斯率领108名冥斗士入侵人类世界，智慧女神雅典娜则带领圣斗士奋起抵抗。经过一场场惨烈鏖战，哈迪斯与冥斗士最终败北，被雅典娜封印，而圣斗士一方也付出了几乎全军覆没的代价。
数千年后，圣斗士们才结束与海王波塞冬的激战，东方某处的女神封印却逐渐失去效力，沉寂于古塔中的冥斗士再度蠢蠢欲动。哈迪斯复活了历次圣战中死去的圣斗士，曾经声名显赫的黄金圣斗士撒加、卡妙和米罗，如今披上闪耀着黑色光泽的冥衣，转而向他们昔日守护的圣域发动进攻。
