《妖魔》讲述了日影与丸郎的故事。两人自幼被遗弃在忍者村，彼此情同手足、形影不离，长大后更成为村中最出色的两名忍者。然而，一天日影突然被手里剑击中，身负重伤。那枚手里剑上涂有毒药，而出手之人正是丸郎。日影中毒卧床之际，丸郎却悄然从村中消失。
日影向村长追问丸郎是否遭到驱逐，村长却表示：“没有你，他会是最强的忍者。我们不能让这样的人留在村子里。”认定村长犯了错的日影于是离开忍者村，踏上寻找丸郎的旅途。可等待他的，竟是恶魔般的存在。恶魔为何盯上日影？丸郎又隐藏着怎样的真实身份？日影的旅程仍在继续，他在与恶魔纠缠的同时，也追寻着恶魔狼。
