《最高危机》将故事设定在1995年。反恐特别行动组的特维斯中校（史蒂文·席格 Steven Seagal 饰）率队执行解救任务，却以失败收场。三个月后，军情局顾问戴维（库尔特·拉塞尔 Kurt Russell 饰）获悉，恐怖组织头目阿布亚法已经落网，即将被引渡至美国。
十天后，一架从雅典飞往华盛顿的747客机遭到劫持。阿布亚法的副手安塔尔控制了飞机，并以释放阿布亚法为条件向美国政府施压。戴维奉命处理这场危机，很快判断出恐怖分子的真正目标并非单纯劫机，而是企图借助毒气炸弹袭击美国本土，因此绝不能让飞机进入美国领空。面对这场迫在眉睫的灾难，特维斯提出了一项大胆计划：率领反恐特别行动组通过空中对接，登上被劫持的747客机。
